Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMAN2Q12907 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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