Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CXCL9Q07325 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms