Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FPGSQ05932 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FPGSQ05932 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms