Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
UBE3AQ05086 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms