Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UBXN1Q04323 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBXN1Q04323 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms