Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPIBQ01892 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPIBQ01892 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPIBQ01892 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms