Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLTCQ00610 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms