Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P62684 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P62684 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms