Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA3P52797 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
EFNA3P52797 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms