Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPC3P51654 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPC3P51654 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPC3P51654 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms