Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FNTBP49356 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FNTBP49356 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FNTBP49356 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms