Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACADSBP45954 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms