Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TNNT2P45379 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNT2P45379 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms