Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCKBRP32239 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms