Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPS1P31327 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPS1P31327 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPS1P31327 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPS1P31327 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPS1P31327 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPS1P31327 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPS1P31327 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPS1P31327 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPS1P31327 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPS1P31327 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPS1P31327 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPS1P31327 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms