Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CMPK1P30085 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms