Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
POLR2AP24928 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms