Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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PTPRAP18433 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTPRAP18433 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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