Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PRG2P13727 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PRG2P13727 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PRG2P13727 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms