Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDH1P12830 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDH1P12830 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms