Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PCNAP12004 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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