Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GLI2P10070 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GLI2P10070 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms