Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SMIM10L2BP0DMW5 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms