Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APODP05090 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APODP05090 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APODP05090 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APODP05090 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APODP05090 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APODP05090 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APODP05090 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APODP05090 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APODP05090 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APODP05090 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
APODP05090 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms