Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PAPLNO95428 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PAPLNO95428 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms