Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SETD1AO15047 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms