Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
C9orf172C9J069 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
C9orf172C9J069 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf172C9J069 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms