Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SOBPA7XYQ1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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