Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C4orf47A7E2U8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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C4orf47A7E2U8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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C4orf47A7E2U8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C4orf47A7E2U8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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