Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWA8A3KMH1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWA8A3KMH1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
VWA8A3KMH1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VWA8A3KMH1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms