Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC78A2IDD5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms