Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
GTF3C3Q9Y5Q9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms