Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RNF11Q9Y3C5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RNF11Q9Y3C5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RNF11Q9Y3C5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.5 ms