Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PACSIN3Q9UKS6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PACSIN3Q9UKS6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3Q9UKS6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms