Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC38A7Q9NVC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC38A7Q9NVC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC38A7Q9NVC3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms