Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ECHDC1Q9NTX5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ECHDC1Q9NTX5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ECHDC1Q9NTX5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms