Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA0

SLC22A11, Solute carrier family 22 member 11, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A11Q9NSA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A11Q9NSA0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC22A11Q9NSA0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC22A11Q9NSA0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms