Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HELLSQ9NRZ9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HELLSQ9NRZ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HELLSQ9NRZ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms