Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MS4A8Q9BY19 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MS4A8Q9BY19 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms