Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TDRD1Q9BXT4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TDRD1Q9BXT4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms