Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIPF4Q9BSR8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF4Q9BSR8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF4Q9BSR8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms