Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NIPSNAP3BQ9BS92 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms