Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COPS8Q99627 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS8Q99627 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms