Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SIN3AQ96ST3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SIN3AQ96ST3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
SIN3AQ96ST3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms