Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBA3Q8TBC4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBA3Q8TBC4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBA3Q8TBC4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms