Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC148Q8NFR7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC148Q8NFR7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms