Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NHLRC2Q8NBF2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NHLRC2Q8NBF2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms