Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNA2D3Q8IZS8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNA2D3Q8IZS8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNA2D3Q8IZS8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms