Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC129Q6ZRS4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC129Q6ZRS4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC129Q6ZRS4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms