Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT39Q6A163 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT39Q6A163 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KRT39Q6A163 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms